جستجو در مقالات منتشر شده


۱ نتیجه برای تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی

سجاد زارع، فرهاد نظریان فیروزآبادی، احمد اسماعیلی، حسن پاک نیت،
جلد ۸، شماره ۳۰ - ( ۳-۱۳۹۸ )
چکیده

مطالعه­ سازوکار‏های تحمل تنش در گیاه جو، می‏تواند به درک بهتر اساس ژنتیکی تحمل به تنش خشکی کمک کند و در نهایت به بهبود خصوصیات ژنتیکی مرتبط با تحمل به تنش خشکی از طریق روش‏های نوین ژنتیک مولکولی منجر شود. به منظور شناسایی و بررسی بیان ژن­های درگیر در تحمل به تنش خشکی گیاه جو، تجزیه و تحلیل ESTهای برگ و ریشه در ژنوتیپ‌های اسپانتانئوم (جو وحشی) و رقم زراعی نیمروز (متحمل در برابر تنش خشکی) صورت گرفت. اطلاعات اولیه کتابخانه­­ها از پایگاه­های جهانی دریافت گردید، سپس پیشپردازش داده­ها و شناسایی ژن­های مرتبط با بیان متفاوت در بین کتابخانه‌ها، به کمک نرم افزارهای بیوانفورماتیک متعددی صورت گرفت. به منظور بررسی بیان ژن­های کاندید با استفاده از روش Real time-PCR، یک آزمایش به صورت فاکتوریل در قالب طرح کاملاً تصادفی با سه تکرار روی ژنوتیپ­ها به عنوان عامل اول و تیمار آبیاری (شاهد و آبیاری در۵۰ درصد FC) به عنوان عامل دوم در گلدان صورت گرفت. همچنین عامل زمان نمونه‌برداری نیز در سه سطح صفر، ۲۴ و ۷۲ ساعت پس از اعمال تنش خشکی لحاظ شد. بر اساس میزان بیان ژن در شرایط تنش، دو ژن به نامهای HvPIP۱;۴ (Plasma Membrane Intrinsic Protein ۱;۴) و HvnsLTP (Non-Specific Lipid Transport; nsLTP) به عنوان ژن­های مهم درگیر در پاسخ به تنش خشکی در جو شناسایی شدند. بر اساس نتایج حاصل از بررسی بیان این ژن­ها مشخص گردید که ژنوتیپ نیمروز به عنوان رقم متحمل از بیان بالاتری برای ژن­های کاندید برخوردار بود، به طوری که ژن­های PIP۱;۴ و nsLTP به ترتیب یک افزایش ۹۸/۹۵ و ۵۴/۵۳ برابری بعد از ۷۲ ساعت نسبت به شرایط شاهد از خود نشان دادند. به­علاوه، نتایج این مطالعه نشان داد که تغییرات میزان بیان ژن PIP۱;۴ در مقایسه با ژن  HvnsLTPجو در ژنوتیپ متحمل نیمروز بطور معنی­داری (P<۰,۰۵) بیشتر از ژنوتیپ اسپانتانئوم بود. از آنجایی که این ژن حرکت آب و مواد محلول غیر باردار و دارای جرم مولکولی پایین را از شامه‏های پلاسمایی و تونوپلاست تسهیل می‏کند، این ژن احتمالاً در روند تحمل به تنش خشکی نقش داشته باشد.
 

صفحه ۱ از ۱     

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به فرآیند و کارکرد گیاهی می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2025 CC BY-NC 4.0 | Journal of Plant Process and Function

Designed & Developed by : Yektaweb