تنش سرما از جمله مهمترین تنش­های محیطی است که رشد و عملکرد گیاه گوجه­فرنگی را محدود می­کند. در این مطالعه دو رقم تجاری گوجه­فرنگی، CaljN3 و PetoMeck  پس از چهار هفته رشد در معرض تنش سرمای   8 درجه سانتی‌گراد قرار داده شدند و در پنج زمان 2، 5، 24، 72، 144 ساعت پس از تیمار مورد بررسی قرار گرفتند. در نمونه­های برداشت شده شاخص بیشینه کارآیی فتوشیمیایی فتوسیستم ΙΙ (Fv/Fm)، محتوای قند محلول و نامحلول، شاخص نشت الکترولیتی و میزان بیان ژن فاکتورهای رونویسی  CBF1   و SlNAC1  با روش  qRT-PCR اندازه­گیری شد.نتایج نشان داد که تحت تنش سرما شاخص بیشینه کارآیی فتوشیمیایی فتوسیستم II در هر دو رقم کاهش یافت. محتوای قند محلول و نامحلول در رقم  CaljN3  تحت تنش سرما، به ترتیب افزایش و کاهش یافت در حالی­که در رقم Meck  Peto تغییر محسوسی مشاهده نشد.  همچنین نتایج آنالیزReal time PCR  نشان داد که بیان SlNAC1 در پنج ساعت تیمار سرما، 5/7 و 5/3 برابر در ارقام Peto Meck  و  CaljN3  افزایش یافت، درحالی­که میزان بیان ژن CBF1  تنها در رقم CaljN3  افزایش یافت. همچنین روند افزایش و کاهش نشت یونی با افزایش و کاهش نسخه­های عوامل رونویسی همبستگی داشت. نتایج این مطالعه پیشنهاد می­کند که تغییر بیان فاکتورهای رونویسی CBF1   و SlNAC1  با تحمل به سرما مرتبط بوده و نتایج بدست آمده نشان می­دهد رقم  CaljN3  دارای مکانیسم مقاومتی بهتر و کارآمدتری نسبت به رقم  Peto Meck  بوده که می­توان آن را به بیان بیشتر  CBF1  نسبت داد و در نتیجه متحمل­تر به تنش سرما می­باشد.